從建系開始海洋科學與工程系就定為要建設(shè)成為國際知名的海洋科學和工程研究基地，致力于培養(yǎng)國際化高層次深海研究人才。近五年海洋系將重點建設(shè)物理海洋學、生物和微生物海洋學、海洋地球物理/地質(zhì)學和海洋工程這四個學科，把參與或引領(lǐng)國際海洋領(lǐng)域研究計劃作為目標，通過國際合作為提升南方科技大學在國際學術(shù)界的知名度做出重要貢獻。海洋系始終把海外人才引進和具有國際視野的高水平師資隊伍建設(shè)放在系發(fā)展的首位。全體教員都具有海外留學或工作的經(jīng)歷，勝任全英文教學。借助深圳市政府籌建的深圳海洋研究院提供的海洋關(guān)鍵技術(shù)研發(fā)的平臺，海洋系將迅速建成并擁有科學考察船（深圳號）、碼頭、海洋裝備和工程技術(shù)實驗室，向世界排名前幾位的美國伍茲霍爾海洋研究所、美國斯克里普斯海洋研究所和英國的南安普頓國家海洋研究中心看齊。培養(yǎng)目標本專業(yè)培養(yǎng)具有良好的思想道德素質(zhì)和較高的人文科學素養(yǎng)，具備海洋科學的基本能理論、基礎(chǔ)知識和基本技能，系統(tǒng)掌握海洋科學特定領(lǐng)域?qū)I(yè)知識和專項技能，能在海洋科學及相關(guān)領(lǐng)域從事科研、教學、管理及技術(shù)研發(fā)工作，具有國際視野以及正確海洋觀的高素質(zhì)科技專門人才?；疽蟊緦I(yè)學生主要學習數(shù)學、物理學、化學、生物學、地質(zhì)學、和海洋科學方面的基本理論和基本知識，學習海洋科學特定領(lǐng)域的專業(yè)知識，接受海洋調(diào)查、海洋觀測、數(shù)據(jù)分析和海洋科學問題研究方面的基本訓練，掌握海洋科學特定專業(yè)領(lǐng)域的工作方法，具有在海洋科學特定專業(yè)領(lǐng)域開展實驗設(shè)計、數(shù)據(jù)采集、研究科學問題和解決應用問題的基本能力。基本課程設(shè)置專業(yè)課程主要分為專業(yè)基礎(chǔ)課和專業(yè)選修課程，設(shè)置主要體現(xiàn)兩方面特點：1）科學理論與工程應用并重；2）多學科交叉、融合專業(yè)基礎(chǔ)課專業(yè)基礎(chǔ)課程(含專業(yè)核心課程)（15門，共50學分）包括：海洋科學導論（4學分）、海洋地質(zhì)學（4學分）、海洋生物學（3學分）、海洋化學（3學分）、物理海洋學（4學分）、海洋地球物理學（4學分）、大氣科學概論（2學分）、海洋調(diào)查與觀測技術(shù)（3學分）、海洋要素分析方法及預報（3學分）、計算方法（3學分）等。專業(yè)選修課程專業(yè)選修課程（10門，共25學分）包括：海洋沉積學（2學分）、地球化學（3學分）、古海洋學（2學分）、地震學（3學分）、礦物學和巖石學（4學分）、海洋要素計算（3學分）等。
